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- カテゴリ:一般
- 発売日:2019/11/29
- 出版社: 羊土社
- サイズ:26cm/254p
- 利用対象:一般
- ISBN:978-4-7581-2243-6
- 国内送料無料
紙の本
RNA−Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ
著者 坊農 秀雅 (編集)
配列解読による発現定量手法であるRNA−Seqの解説書。データ解析環境の準備から配列解析の外注、データ入手、論文投稿に必要なSRAへのデータ登録までを解説する。更新情報の...
RNA−Seqデータ解析 WETラボのための鉄板レシピ
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商品説明
配列解読による発現定量手法であるRNA−Seqの解説書。データ解析環境の準備から配列解析の外注、データ入手、論文投稿に必要なSRAへのデータ登録までを解説する。更新情報のサービスコード付(図書館での利用不可)。【「TRC MARC」の商品解説】
医学・生命科学で細胞の特性や差異の解析に汎用されるRNA-Seqは,データをどう料理するかが腕の見せどころ.PC 1台から実践できる一流シェフ(データサイエンティスト)のレシピを,みんなのラボへ.【商品解説】
目次
- Chapter 1 まずはこれだけ! 解析環境を整える〜Mac+Biocondaを中心に
- Chapter 2 データを入手する
- (1)RNA-Seqの注意点〜外注時のリード数,小分子・長分子での違いなど
- (コラム)RNA-Seq vs マイクロアレイ
- (2)公共データの利用〜AOEとRefEx,SRAデータ取得,メタ解析
- Chapter 3 転写産物の発現を定量する
- (1)リファレンスゲノムにマッピングする方法①〜HISAT2+StringTie
- (2)リファレンスゲノムにマッピングする方法②〜STAR+RSEM
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