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- カテゴリ:大学生・院生
- 発売日:2016/09/08
- 出版社: 共立出版
- サイズ:21cm/107p
- 利用対象:大学生・院生
- ISBN:978-4-320-11252-0
紙の本
ゲノムデータ解析 (統計学One Point)
GWASにおけるデータ検証から民族集団構造化問題までを実際の論文を挙げて解説。ハプロタイプ、連鎖不平衡(LD)をはじめ、サンプルQC、SKATやその亜種を含めたレアバリア...
ゲノムデータ解析 (統計学One Point)
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商品説明
GWASにおけるデータ検証から民族集団構造化問題までを実際の論文を挙げて解説。ハプロタイプ、連鎖不平衡(LD)をはじめ、サンプルQC、SKATやその亜種を含めたレアバリアント解析などの遺伝統計手法を幅広く網羅。【「TRC MARC」の商品解説】
GWASにおけるデータ検証(コールレイト,ハーディ・ワインベルグ平衡等のマーカーQC)から民族集団構造化問題(主成分分析EIGENSTRAT,ゲノミック・コントロール)などを実際の論文を挙げて解説し,Rパッケージを用いた分析手法の紹介,QQプロット,false discovery rate (FDR),マイナーアレル頻度等からなるサンプルサイズの関係がわかりやすく説明されています。ハプロタイプ,連鎖不平衡(LD),関連解析をはじめ,サンプルQC,遺伝的インピュテーション,SKATやその亜種を含めたレアバリアント解析などの遺伝統計手法を幅広く網羅し,これからゲノムデータ解析を勉強しようという方だけでなく,これまでにゲノムデータ解析に従事・研究されてきた諸兄も振り返って見直せるよう,読みやすい形に仕上がっています。【商品解説】
目次
- 第1章 ゲノムデータ解析
- 1.1 ゲノムデータ解析の流れ
- 1.2 数値例:分析と結果
- 1.3 サンプルサイズ,検出力
- 1.4 ゲノム遺伝子検査
- 1.5 まとめ
- 第2章 ハプロタイプ解析
- 2.1 ハプロタイプの推定
- 2.2 連鎖不平衡
- 2.3 ハプロタイプ・ブロックの同定
著者紹介
冨田 誠
- 略歴
- 〈冨田誠〉東京医科歯科大学医学部附属病院臨床試験管理センター准教授。博士(理学)。
〈植木優夫〉久留米大学バイオ統計センター准教授。博士(環境学)。
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