マイクロバイオームの世界 あなたの中と表面と周りにいる何兆もの微生物たち

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近年注目を集めているのが、ヒトの表面や内部にいる微生物である。皮膚や口腔、鼻腔、腸、肺、さまざまな場所に存在している。
微生物というといわゆる「ばい菌」で、汚いもの、排除しなくてはならないものという印象を持つ人もいるかもしれないが、大部分はヒトに害をなすわけではなく、ヒトとうまく共生している。ときにヒトを助け、ときにヒトから利益を受け、ごくたまに例外的にヒトに悪さをする。
いつもそこにいる「常在菌」とヒトは、長い時間を掛けて互いに「適応」し、関係を築き上げてきたのだ。

本書はこうした身近な微生物の世界について紹介する１冊である。アメリカ自然史博物館で、マイクロバイオームをテーマとした展示会が開かれた際に制作されたものとのことで、基本的な解説からやや突っ込んだ話まで、マイクロバイオーム研究の今を俯瞰する内容になっている。

健康なヒトの体の細胞のおそらく９０パーセントは微生物で、体重の３パーセントは彼らに由来すると考えられている。
１人のヒトの中には、多種多様な微生物が存在する。マイクロバイオームとは、ヒトの一部分などの特定のエリアにある微生物のタイプと数を指す。

体表面や体内に数多く存在している微生物たちがヒトに大きな影響を持っていることは推測されてはきた。しかし、分離し、培養することが難しい菌も多く、詳細を知ることは困難だった。元いた環境から引き離し、育て増やして詳しく調べる前に、脱落してしまうものが多かったのだ。その結果、もちろん、すべての菌を入手することは出来ないし、増えてくるものは元の環境では少数派だったということも往々にしてあった。
近年、核酸配列決定に関する技術が著しく発展したことから、詳細が調べやすくなった。菌を１種ずつ分別して、確定しなくても、全体として、存在する核酸の配列を調べていくことで、何の仲間の菌がどの程度いるかをざっくりと知ることが出来るようになったのだ。
これを使ってヒトの体内、外表面、周囲環境のマイクロバイオームを調べていくと、おもしろいことがわかってきた。
マイクロバイオームは個体間でも異なるし、１人のヒトの部位間でも相当異なる。病気のヒトと健康なヒトの間では存在する菌の傾向が異なる。同一人物でも眉間に存在する菌集団と足指の間に存在する菌集団はまったく異なるし、驚くことに、右手と左手（利き手とそうではない手）でも相当異なる。
さらに大規模で長期に渡る研究も行われている。例えば複数の地下鉄の駅を調べたり、公共施設を調べたり、都市間で比較したりされてきている。パソマップ（Pathomap）といった病原体地図の試みもある。
家族間ではマイクロバイオームは似通ってくるし、キスでも「病原体交換」の痕跡は残る（だから徒な不倫にはご用心！）。
犬を飼っている家とペットのいない家ではかなりの差が出る。
発想次第で、さまざまなマイクロバイオームを調べて比べてみると、思いもよらなかったことがわかるかもしれない。

おもしろい例としては、お風呂やシャワーにご無沙汰しているヒトのへそから発見された菌が、一��的な動植物が生息不能な「極限環境」に棲む古細菌の仲間だとわかった研究がある。これは極端な例だが、へそは体表面の中でも特に菌集団の多様性が高く、そのマイクロバイオームから個人が割り出せるほどであるようだ。

微生物は一概によい菌・悪い菌と分けられる場合ばかりではない。マイクロバイオーム全体のバランスが崩れた際に不調を来すこともある。
胃に住む細菌、ヘリコバクター・ピロリは胃癌と強い相関があることが認められたが、この細菌を省いてしまうと、今度は逆流性胃炎などの別の病気を招くこともわかってきている。
多様な菌が棲み着いているヒトの体では、１つの種のみが極端に増えたり、１つの種を除いたりすると、思わぬ結果を呼ぶ可能性もある。そのあたりは、マクロな生態系と同様だろう。

健康なヒトの便を使った腸疾患の治療（実際に試みは始まっている）や、腸内細菌が精神疾患にも関係するかもしれないといった、実用につながっていきそうな話も興味深いが、まずはヒトとマイクロバイオームの関係をより慎重により深く調べていくことが望ましいだろう。
長い年月を掛け、相手の出方を探りながら、微生物はヒトの中に住処を見つけ、ヒトは彼らを利用してきた。そのわくわくするような多様で複雑な関係は今後、さらに明らかになっていくことだろう。

一般向けの本ではあり、なるべく噛み砕いた説明を目指している感は受けるのだが、生物学の基礎知識がないと呑み込みにくい箇所はあるように思う。アメリカのテレビ番組や日本未公開映画を例に出すたとえが散見されるが、日本の読者には逆にわかりにくいだろう。
とはいえ、この方面に興味のある方は読んで損はないと思う。

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微生物の世界がこんなに多様なもので，知られていない種類の微生物が非常に多いことに驚いた．細菌，古細菌，真核生物などある程度知っていた言葉もあったが，具体的な最近の名前は馴染みがないものばかりだ．我々が住んでいる世界にはわからないことの方が多いのかもしれない．枕カバーと便座の細菌が同程度だという記述にはゾッとする感じだ．微生物と共存している事実を再認識できた．

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近年のテクノロジーの進化によって明らかになった、「微生物」の最前線。細菌、古細菌の進化史から始まり、無数とも言える種類の微生物を検出、同定できるようになった最新のDNA検査技術、人間の皮膚や口腔内、腸内をはじめ身体中に共生している微生物とその人間との関わりまでを概説する。

ちょっと難しくて、半分くらいは理解できなかったかなー。関連図書をもう2,3冊読んでみよう。

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本書はマイクロバイオームの本としては難易度は高め。聞きなれない微生物の名前が頻出する。
内容としては、生物史から入り、マイクロバイオームについて多面的に考察。
訳者後書きでも勧められていたが、あなたの体は9割が細菌と重複する内容も多々あり、読む順番としては間違ってなかったかなと。
やはり興味深いのは肥満や自閉症スペクトラムが微生物の影響を受けている可能性が高いと言う話。なんとか解明されて、治療出来ることを望む。
その他気になったのは土を食べて腸内環境を劇的に変えようと言う話。今の積読本にあったはず…。