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目次

バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム

バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム (アルゴリズム・サイエンスシリーズ 適用事例編)

  • 阿久津 達也(著)/ 杉原 厚吉(編)/ 室田 一雄(編)/ 山下 雅史(編)/ 渡辺 治(編)
  • 第1章 分子生物学概観
    • 1.1 DNAとRNA
    • 1.2 セントラルドグマ
    • 1.3 タンパク質
    • 1.4 分子生物学とデータベース
  • 第2章 配列アラインメント
    • 2.1 ペアワイズアラインメント
    • 2.2 ローカルアラインメント
    • 2.3 線形領域アラインメント
    • 2.4 スコア行列とアラインメントスコアの統計的評価
    • 2.5 ホモロジー検索
    • 2.6 マルチプルアラインメント
  • 第3章 配列解析
    • 3.1 配列モチーフ
    • 3.2 隠れマルコフモデル
    • 3.3 カーネル法
    • 3.4 ゲノム配列推定
    • 3.5 ゲノム再編成
  • 第4章 進化系統樹推定
    • 4.1 有根系統樹と無根系統樹
    • 4.2 系統樹の個数
    • 4.3 距離行列法
    • 4.4 最節約法
    • 4.5 進化の確率モデル
    • 4.6 系統樹の評価と比較
  • 第5章 高次構造解析
    • 5.1 RNA2次構造予測
    • 5.2 RNA2次構造比較
    • 5.3 タンパク質立体構造予測
    • 5.4 タンパク質立体構造比較
  • 第6章 ネットワーク解析
    • 6.1 遺伝子発現データ解析
    • 6.2 遺伝子ネットワーク
    • 6.3 タンパク質相互作用推定
    • 6.4 ネットワーク構造解析
  • 参考文献
  • 索引