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目次

蛋白質の柔らかなダイナミクス

蛋白質の柔らかなダイナミクス (非線形科学シリーズ)

  • 笹井 理生(著)/ 中村 勝弘(編)
  • 1.柔らかいダイナミクスの空間と時間とエネルギー
    • 1.1 細胞の空間と時間
    • 1.2 蛋白質の空間と時間とエネルギー
  • 2.蛋白質フォールディング:蛋白質は自発的に秩序構造をつくる
    • 2.1 フォールディング転移
    • 2.2 コンシステンシー原理
    • 2.3 Levinthalのパラドクス
    • 2.4 ランジュバン動力学計算
  • 3.蛋白質フォールディングのエネルギーランドスケープ描像
    • 3.1 でたらめ配列とガラス転移
    • 3.2 極小フラストレーション原理
    • 3.3 エネルギーランドスケープ理論とフォールディング過程
    • 3.4 立体構造予測
    • 3.5 エネルギーランドスケープ理論の表したもの
  • 4.蛋白質の進化シミュレーション
    • 4.1 蛋白質の起源をめぐって
    • 4.2 機能に対する要求による進化
    • 4.3 進化におけるゆらぎ
    • 4.4 個体発生は系統発生を繰り返す
  • 5.ソフトマシンとしての蛋白質
    • 5.1 蛋白質の機能発現
    • 5.2 アロステリック転移のしくみ
    • 5.3 蛋白質震:局所的な変化によって引き起こされる大きな変化
    • 5.4 筋肉が力を出すしくみ
    • 5.5 柔らかな変形とエネルギー変換
    • 5.6 蛋白質の柔らかなダイナミクスと機能ファネル
  • 6.生体分子ネットワークの柔らかいダイナミクス
    • 6.1 遺伝子発現におけるノイズ
    • 6.2 生体分子ネットワーク
  • 7.確率的細胞生物学へ
    • 7.1 多アトラクターシステム:超高次元空間をみる
    • 7.2 ボトムアップ設計
    • 7.3 細胞のゆらぎと行動