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目次

  • 第1章 タンパク質構造の基礎
    • 1.1 タンパク質の階層構造分類
    • 1.2 タンパク質の全体構造による分類
    • 1.3 タンパク質の機能による分類
    • 1.4 タンパク質構造の進化
  • 第2章 タンパク質構造の物理化学
    • 2.1 タンパク質の変性とフォールディング
    • 2.2 構造をつくる相互作用
    • 2.3 タンパク質のフォールディング問題
    • 2.4 タンパク質の構造ダイナミクスと構造変化
  • 第3章 タンパク質の立体構造の特徴抽出と構造比較
    • 3.1 コンピュータグラフィックスによる可視化
    • 3.2 立体構造からの特徴抽出
    • 3.3 立体構造比較
  • 第4章 タンパク質の配列・構造・機能の関係
    • 4.1 配列と構造の進化的な保存性
    • 4.2 プロテインデータバンク(wwPDB)
    • 4.3 構造の保存性・構造分類データベース
    • 4.4 配列と構造の関係−配列データベース(Pfam)
    • 4.5 構造と機能の関係−機能分類データベース(UniProt)
  • 第5章 アミノ酸配列からの構造予測とデザイン
    • 5.1 二次構造予測
    • 5.2 立体構造予測
    • 5.3 膜タンパク質の構造予測
    • 5.4 天然変性領域予測
  • 第6章 分子シミュレーション的な技法
    • 6.1 全原子モデルの分子シミュレーション
    • 6.2 粗視化モデルによる巨大システムのシミュレーション
    • 6.3 ドッキングによる複合体予測
    • 6.4 創薬への応用
  • 第7章 立体構造決定法
    • 7.1 立体構造情報を得る
    • 7.2 X線結晶解析
    • 7.3 NMR
    • 7.4 電子顕微鏡単粒子解析
    • 7.5 生体超分子の立体構造解析

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