目次
新たな魚類大系統 遺伝子で解き明かす魚類3万種の由来と現在 (シリーズ・遺伝子から探る生物進化)
- 宮 正樹(著)/ 斎藤 成也(監修)/ 塚谷 裕一(監修)/ 高橋 淑子(監修)
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<b>第1章 系統学事始め</b>
1.1 “Connecting the dots”(点と点をつなげる)
1.2 系統学における“connecting the dots”
1.3 現生種は共通祖先を通じて結ばれる
1.4 遺伝子と分子系統学
1.5 系統学における「既成概念」
1.6 研究のフロンティアとインパクト
1.7 サイエンスにおける発見の喜び
<b>第2章 研究の世界との出合い</b>
2.1 釣りにのめり込んだ少年時代
2.2 大学入学
2.3 アカデミアの世界を知る
2.4 深海魚との出合い
2.5 大学院入試と卒論
<b>第3章 深海性オニハダカ属魚類の研究へ</b>
3.1 深海性オニハダカ属魚類の生態研究
3.2 系統学理論の勉強
3.3 比較形態に基づくオニハダカ属の系統解析
3.4 博物館への就職
3.5 西田睦さんとの出会い
3.6 科研費の壁
3.7 分子生物学実験入門
3.8 オニハダカ属魚類の分子系統樹
3.9 オニハダカ属魚類の進化史再構成
3.10 外洋における種分化
3.11 終わりの始まり
<b>第4章 新たなミトコンドリアゲノム全長配列決定法
―― ロングPCRの応用</b>
4.1 きっかけは深海魚
4.2 ミトコンドリアとミトコンドリアゲノム
4.3 脊椎動物のミトゲノム
4.4 これまでの実験法
4.5 ロングPCR
4.6 PCRの原理
4.7 ヨコエソのミトゲノム増幅 ―― 最初の挑戦
4.8 プライマーの再設計で仕切り直し
4.9 新たなミトゲノム全長配列決定法
4.10 ユニバーサルプライマーの開発
4.11 ユニバーサルプライマーの検証
4.12 DNA塩基配列決定法の原理
4.13 ヨコエソのミトゲノム全長配列決定
<b>第5章 魚類大系統解明へ向けた基盤形成</b>
5.1 ミトゲノムデータの有用性の検証
5.2 大きいことはいいことだ!
5.3 問題解決能力の検証 ―― 下位真骨類の大系統
5.4 新たなマーカーの発見
5.5 プロジェクトの発進
5.6 条鰭類の大系統解明 ―― その第一歩
5.7 魚類とは何か
5.8 問題の歴史的背景その1:進化に対する段階群的(類型的)認識
の時代
5.9 問題の歴史的背景その2:進化的段階群の解体
5.10 問題の歴史的背景その3:分岐学理論の登場
5.11 問題の歴史的背景その4:分岐学理論のエッセンス
5.12 問題の歴史的背景その5:権威主義の横行と分子系統第一世代の
挑戦
5.13 問題の歴史的背景その6:分子系統第二世代の挑戦
5.14 分子系統第三世代の挑戦 ―― ミトゲノム全長配列による上位真
骨類系統の解明
<b>第6章 条鰭類の大系統解明 ―― 全体像を4つに分けて示す</b>
6.1 下位条鰭類
6.2 ニシン・骨鰾類
6.3 原棘鰭類(下位正真骨類)
6.4 上位(正)真骨類
<b>第7章 スズキ類の大系統 ―― 混沌から見えてきたもの</b>
7.1 スズキ類に対する3つのアプローチ
7.2 スズキ類論文で味わった挫折と再出発
7.3 スズキ類における10個の包括的単系統群
7.4 「ベラ亜目」の実体とオヴァレンタリアの発見
7.5 「トゲウオ目」の実体とヨウジウオ目の創設
7.6 フグの仲間のユニークな進化
7.7 ペラジアの発見と外洋における適応放散
<b>第8章 新天地を求める魚たち、新天地に連れて行かれる魚たち</b>
8.1 白亜紀末の深海魚から進化したペラジア
8.2 表層から深層へ―― 三変化する深海魚
8.3 ルアーを武器に深層へ
8.4 ウナギの祖先も深海魚
8.5 淡水魚の進化と大陸移動
8.6 シーラカンス2種の進化と大陸移動
<b>第9章 魚の過去から現在・未来へ</b>
9.1 悪夢の科研費不採択
9.2 窮余の策「環境DNA」
9.3 魚類環境DNAメタバーコーディングの技術開発
9.4 魚の過去から現在・未来へ
おわりに
参考文献
索引
生命科学・生物学 ランキング
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