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目次

    序にかえて-個体を分解して理解するシングルセルゲノミクス

    第1章 総論:プロジェクト・技術の動向
    1.シングルセルゲノミクスのプラットフォーム
    2.医学・生物学研究に実装されるシングルセルゲノミクス
    3.シングルセルRNA-seq情報解析最前線
    4.世界と日本におけるHuman Cell Atlasの構築

    第2章 シングルセル解析によるバイオロジー
    Ⅰ.発生・臓器・オルガノイド
    1.心筋シングルセル解析による病態解明から臨床応用
    2.腸管上皮のシングルセル解析
    3.肝臓オルガノイドのシングルセル解析
    4.単細胞レベルでの膵内分泌細胞の不均一性と機能解明
    5.シングルセル解析で広がるヒト腎臓発生と病態の理解
    6.シングルセルRNA-seqを用いた肺線維症の解析―データベースを用いた具体的な解析方法の紹介

    Ⅱ.免疫・がん
    7.シングルセルレベルでのT細胞受容体・B細胞受容体解析
    8.T細胞におけるシングルセル解析
    9.レンバチニブと抗PD-1抗体の併用による腫瘍免疫調節作用の解析
    10.大腸がん組織を構成する細胞集団の多様性
    11.シングルセル遺伝子発現解析からみえてきた腫瘍内不均一性
    12.成人T細胞白血病研究におけるシングルセル解析の有用性
    13.HTLV-1感染動態の数理モデル型定量的データ解析
    14.リキッドバイオプシーの実現に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル解析

    Ⅲ.その他
    15.iPS細胞のシングルセル遺伝子発現解析
    16.1細胞RNA-Seqによる神経前駆細胞の制御機構解析の動向
    17.ウイルス感染細胞の不均一性(heterogeneity)の網羅的描出
    18.メタゲノムデータからの微生物ゲノムの再構成

    第3章 技術開発
    1.進歩を続ける1細胞トランスクリプトーム計測法
    2.シングルセルゲノム情報解析の基盤技術
    3.クロマチン挿入標識法(ChIL)による単一細胞エピゲノム解析
    4.シングルセル遺伝子発現解析(Nx1-seq)と細胞集団
    5.C1 CAGE法を用いた一細胞転写開始点解析
    6.マイクロバイオームのシングルセル解析
    7.蛍光イメージングによる網羅的シングルセル解析
    8.SINC-seq法による1細胞多階層解析

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